Les activités de WANEP-Togo tournent autour de cinq programmes:
- JEP (Jeunesse et Education à la Paix)
- FPS (Femmes, Paix et Sécurité)
- WARN (Warning Response Network) (Alerte Précoce et Prévention des Conflits)
- Recherches et Plaidoyers
- Interventions spéciales
